Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CttnQ60598 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms