Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q9

Uimc1, BRCA1-A complex subunit RAP80, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uimc1Q5U5Q9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uimc1Q5U5Q9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms