Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms