Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trdv2-2Q5R1A4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms