Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ecm2Q5FW85 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms