Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam208bQ5DTT3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam208bQ5DTT3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Fam208bQ5DTT3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Fam208bQ5DTT3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Fam208bQ5DTT3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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