Protein–RNA interactions for Protein: Q58A65

Spag9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag9Q58A65 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spag9Q58A65 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spag9Q58A65 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms