Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx25Q3ZT31 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx25Q3ZT31 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms