Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms