Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Kdm5aQ3UXZ9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms