Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc114Q3UX62 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc114Q3UX62 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms