Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Usp30Q3UN04 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Usp30Q3UN04 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms