Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc33Q3ULW6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc33Q3ULW6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms