Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trip13Q3UA06 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip13Q3UA06 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms