Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Cops9Q3U898 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Cops9Q3U898 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cops9Q3U898 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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