Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf180Q3U827 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Rnf180Q3U827 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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