Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp6Q3U6U5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gtpbp6Q3U6U5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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Gtpbp6Q3U6U5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms