Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hvcn1Q3U2S8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hvcn1Q3U2S8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms