Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Serac1Q3U213 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms