Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Palb2Q3U0P1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms