Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Lrrn4clQ3TYX2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms