Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc102aQ3TMW1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc102aQ3TMW1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms