Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Uri1Q3TLD5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uri1Q3TLD5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms