Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prr27Q3SYJ2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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