Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH17

Trim72, Tripartite motif-containing protein 72, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim72Q1XH17 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim72Q1XH17 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim72Q1XH17 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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