Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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Shroom4Q1W617 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
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Shroom4Q1W617 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Shroom4Q1W617 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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