Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntnap5cQ0V8T7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntnap5cQ0V8T7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms