Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vps8Q0P5W1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vps8Q0P5W1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms