Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
1700061G19RikQ08EE8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms