Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnma1Q08460 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kcnma1Q08460 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms