Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gata4Q08369 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms