Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn2Q08093 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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