Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col9a2Q07643 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col9a2Q07643 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms