Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cab39Q06138 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cab39Q06138 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms