Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mex3cQ05A36 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mex3cQ05A36 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mex3cQ05A36 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mex3cQ05A36 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms