Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PtprgQ05909 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms