Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Col6a1Q04857 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms