Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RelaQ04207 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RelaQ04207 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms