Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VegfaQ00731 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms