Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
SeleQ00690 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms