Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gabpb1Q00420 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms