Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Flt3Q00342 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Flt3Q00342 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms