Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pax8Q00288 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms