Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AlkP97793 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AlkP97793 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AlkP97793 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AlkP97793 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
AlkP97793 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.27■■□□□ 1
AlkP97793 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AlkP97793 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AlkP97793 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AlkP97793 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms