Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cry1P97784 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cry1P97784 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cry1P97784 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cry1P97784 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cry1P97784 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms