Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smyd1P97443 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smyd1P97443 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms