Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps45P97390 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps45P97390 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms