Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mesp1P97309 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mesp1P97309 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mesp1P97309 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mesp1P97309 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mesp1P97309 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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