Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcdP82347 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgcdP82347 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcdP82347 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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