Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx3P81067 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Irx3P81067 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Irx3P81067 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms